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12角は6角の2倍ですから当然ボルト・ナットに嵌めやすくなります。 しかし、ボルト・ナットに掛かる力は接触面が少なくなって小さくなります。 また、接触面が小さくなるのでボルト・ナットの頭を滑らせて潰してしまうこともあります。
作業性優先の時は12角、しっかり、確実に締めたい時は6角を使います。